ד"ר אסף לוי: הרחבה על הגנטיקה של קורונה-וירוס

ד"ר אסף לוי: הרחבה על הגנטיקה של קורונה-וירוס

29/03/2020

הרחבה על הגנטיקה של קורונה-וירוס:

מדובר בוירוס רנ"א. כלומר במקום שהקוד הגנטי (הגנום) שלו מוחזק כמולקולת דנ"א בדומה לרוב היצורים בעולם, כולל וירוסים רבים, הוא מכיל גדיל אחד של מולקולת רנ"א. ברגע שהוירוס משחרר את הרנ"א בתא הוא גורם לתא המאכסן (התא שלנו) לייצר ישירות מההוראות המקודדות ברנ"א חלבונים שירכיבו וירוסים חדשים ויצאו להדביק תאים נוספים.
פחות משבוע אחרי שאותר וירוס הקורונה חוקרים כבר הצליחו לרצף (כלומר לקרוא את הרצף) את גנום הרנ"א של הוירוס. נמצא שהוא בגודל 30,000 "אותיות" רנ"א. מדובר ברצף קטן, פי 100,00 יותר קטן מרצף הגנום שלנו. הוא מכיל מספר קטן של גנים, אך הוא נחשב לגדול ביחס לגנום של וירוסים דומים. מולקולת רנ"א רגישה יותר ממולקולת דנ"א ולכן לרוב יש מגבלה ביולוגית על תחזוקה של רצף גנטי גדול מדי של רנ"א משום שהוא יעבור יותר מדי מוטציות אקראיות שבעיקר "ידפקו" את האורגניזם. וירוסי רנ"א עוברים מוטציות באופן מהיר יותר מירוסי דנ"א ולכן יותר קשה לפתח להם חיסונים.

רצף זה חשוב משתי סיבות:
1. הוא מאפשר אבחון מדויק של חולים ובריאים. ניתן לקחת דגימה מחולה חשוד ובהליך פשוט וזול שנקרא RT-PCR לבדוק אם היא מכילה רצף המתאים לרצף הקורונה. אבחון זה מתבצע ע"י השוואת רצף הרנ"א של הוירוס מהחולה לרצף הידוע.
2. ניתן לרצף המון וירוסים מחולים שונים ברחבי העולם וכך לעקוב אחרי השינויים (אבולוציה) שהוירוס עובר במהלך הזמן. כמו כן ע"י השוואת הרצפים ניתן לאתר את מקור ההדבקה (רצפים דומים מאד מצביעים על מקור משותף) וכך לנסות לבלום אותה.
בנוסף יש התפתחות טכנולוגית נוספת המאפשרת לנו בזול להדפיס את הקוד הגנטי. דמו שריצוף הוא למעשה קריאת הקוד הגנטי ופה אני מדבר על כתיבת קוד גנטי. ע"י כך אפשר לנסות לבחון באופן מקיף שינויים רבים שהוירוס עובר או עשוי לעבור וכך לבדוק אם חיסון עתידי יצליח למנוע הדבקה של וירוס באופן אפקטיבי.

 

ד"ר אסף לוי

המחלקה למחלות צמחים ומיקרוביולוגיה 

הפקולטה לחקלאות, מזון וסביבה